拡張ファイルのアップロード方法がわかりません。
Devleloper Consoleのヘルプを見ると

注: 現在のところ、新しい Google Play デベロッパー コンソールの制限により、新しいアプリをアップロードする最初の APK ファイルに拡張ファイルを追加することはできません。この問題を回避するには、まず APK ファイルのみをアップロードし、必要に応じて拡張ファイルを追加した APK ファイルで置き換えてください。これらの操作はドラフト状態の APK でも行えますので、既存ユーザーや潜在ユーザーに影響が及ぶことはありません。

どうやら拡張ファイルを追加できない事はわかります。しかし回避するための方法がわかりません。
「拡張ファイルを追加したAPKファイルで置き換えてください」？
それじゃあ、APKと拡張ファイルが一体化しているじゃないですか！

頑張って調べてみると

http://stackoverflow.com/questions/15109191/how-to-upload-apk-expansion-files-in-new-developer-console

がヒット。

it’s a dummy apk. When you first upload your apk you will not have any option for the expansion files. From second apk onwards you will have that option. It looks weird

同じAPKファイルを2回アップロードすると2回目は拡張ファイルをアップロードするオプションが出てくる。
(1回目は出てこない)

なんだそりゃー！